224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5345 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5345  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  322  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10950  transcriptional regulator  53.73 
 
 		 175 aa  138  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  33.85 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3355  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496446  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9046  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3128  regulatory protein, MarR  39.31 
 
 		 204 aa  74.3  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  44.21 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 183 aa  67  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37340  transcriptional regulator  36.46 
 
 		 198 aa  60.8  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.186615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3813  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2662  transcriptional regulator, MarR family  38.55 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  29.8 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3332  transcriptional regulator, MarR family  36.21 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135407  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  38.66 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  33.05 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7578  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  44.29 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  33.05 
 
 		 185 aa  52.4  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 145 aa  51.2  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  44.64 
 
 		 180 aa  51.2  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 164 aa  50.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 157 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 185 aa  50.8  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  28.09 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  46.81 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 197 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  48.15 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  35.09 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2768  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  24.82 
 
 		 184 aa  48.9  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 163 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  35.53 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 178 aa  48.5  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 171 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 191 aa  48.1  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 191 aa  48.1  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 198 aa  48.1  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 164 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 167 aa  48.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 157 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  39.06 
 
 		 150 aa  47.8  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 203 aa  47.4  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 212 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23740  transcriptional regulator  27.05 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  26.05 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  22.55 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  32.29 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>