76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_10950 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_10950  transcriptional regulator  100 
 
 		 175 aa  342  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5345  hypothetical protein  53.73 
 
 		 162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3128  regulatory protein, MarR  39.29 
 
 		 204 aa  84.7  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3355  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 175 aa  84  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496446  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  35.2 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  39.64 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9046  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3813  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37340  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 198 aa  60.8  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.186615 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3332  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135407  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2662  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  32.85 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  32.41 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 153 aa  52  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  28.86 
 
 		 185 aa  50.8  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 152 aa  50.8  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18870  transcriptional regulator  34.91 
 
 		 158 aa  48.1  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.452318  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 145 aa  48.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 161 aa  48.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23740  transcriptional regulator  30.4 
 
 		 159 aa  47.4  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04490  MarR family regulator  34.62 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  27.35 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  29.75 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  27.59 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  28.48 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 		 155 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 145 aa  45.4  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 		 145 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 161 aa  45.1  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 162 aa  45.1  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  36 
 
 		 162 aa  45.1  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 145 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  24.44 
 
 		 149 aa  44.7  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  31.91 
 
 		 177 aa  44.7  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  44.3  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  39.39 
 
 		 150 aa  44.7  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  42.19 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1292  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 150 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  36.07 
 
 		 220 aa  42.7  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  25.96 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 171 aa  42.4  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2098  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 155 aa  42  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0688139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 180 aa  41.6  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 162 aa  42  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3523  transcriptional regulator, TrmB  27.13 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 139 aa  41.6  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2959  transcriptional regulator, MarR family  27.86 
 
 		 151 aa  41.2  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000427838 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 168 aa  41.2  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  27.96 
 
 		 174 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>