152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_23740 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_23740  transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  316  1e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7578  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 173 aa  51.6  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 156 aa  50.8  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  28.7 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  28.91 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10950  transcriptional regulator  30.94 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  33.73 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  33.73 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  34.94 
 
 		 168 aa  47.8  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  24.46 
 
 		 140 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 136 aa  47.4  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5345  hypothetical protein  26.12 
 
 		 162 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  29.61 
 
 		 184 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1149  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.332522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  26.53 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  31.16 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1224  transcriptional regulator, MarR family  30.86 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414695  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10480  putative transcriptional regulator  27.2 
 
 		 140 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  39.66 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1523  MarR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 176 aa  44.7  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.7127  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  24.37 
 
 		 189 aa  44.3  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 145 aa  44.3  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_774  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 		 171 aa  44.3  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.489268  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2359  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 176 aa  43.9  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.534803 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 183 aa  44.3  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 143 aa  44.3  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0871  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0438869  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  34.94 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  32.86 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8732  hypothetical protein  34.41 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0789  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  23.89 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  27.37 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 145 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  34.94 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 		 177 aa  42.4  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  27.1 
 
 		 180 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 142 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 149 aa  42  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  36 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  25.34 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  27.66 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 142 aa  42  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  24.78 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 142 aa  42  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 151 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>