More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7578 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7578  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 162 aa  326  7e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  30.46 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3523  transcriptional regulator, TrmB  28.08 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  21.32 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23740  transcriptional regulator  28.95 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0789  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  49.02 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  26.95 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  31.3 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5345  hypothetical protein  29.01 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  29.84 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2959  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000427838 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 139 aa  52  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  37.93 
 
 		 139 aa  52  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 136 aa  52  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 		 159 aa  51.2  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  24.06 
 
 		 161 aa  51.2  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 152 aa  51.2  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 154 aa  50.8  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 137 aa  50.8  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0643  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0797969 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 153 aa  50.4  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_774  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 171 aa  50.4  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.489268  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 166 aa  50.4  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  39.66 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  32.05 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  28.43 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  32.05 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  28.43 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  38.57 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1841  transcriptional regulator, TrmB  27.91 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100194  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  41.38 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  48.98 
 
 		 145 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 176 aa  48.1  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0199  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 165 aa  48.1  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  25.66 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 163 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  26.79 
 
 		 149 aa  47.8  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  40.32 
 
 		 166 aa  47.8  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  47.8  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  32.41 
 
 		 162 aa  47.8  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0871  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 161 aa  47.4  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0438869  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  26.52 
 
 		 177 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  36.23 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2098  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 155 aa  47.4  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0688139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 161 aa  47.4  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2462  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2221  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2182  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242743  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2527  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  35.38 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1519  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0826678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 207 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  36.51 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>