More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2773 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 157 aa  305  2.0000000000000002e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  43.26 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1519  transcriptional regulator, MarR family  49.24 
 
 		 180 aa  105  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0826678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  41.54 
 
 		 153 aa  104  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3523  transcriptional regulator, TrmB  37.14 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0643  transcriptional regulator, MarR family  38.73 
 
 		 151 aa  99.4  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0797969 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0881  MarR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 168 aa  98.2  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  38.64 
 
 		 149 aa  97.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2098  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 155 aa  94.4  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0688139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2959  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 151 aa  87  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000427838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  38.69 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1841  transcriptional regulator, TrmB  40.14 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100194  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7578  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  36.92 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  50.62 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  40.32 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  35.83 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 		 173 aa  63.9  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  33.06 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  40.23 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  25.27 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2650  transcriptional regulator, MarR family  23.36 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038621  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 169 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3332  transcriptional regulator, MarR family  38.53 
 
 		 160 aa  50.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135407  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1701  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000687846 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  31.46 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6171  Transcriptional regulators-like protein  36.26 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  46.03 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  46.03 
 
 		 178 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  31.17 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 155 aa  48.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  34.4 
 
 		 166 aa  48.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 171 aa  48.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  39.56 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  26.89 
 
 		 174 aa  47.8  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 174 aa  47.8  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 143 aa  47.8  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  36.11 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 160 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 160 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2662  transcriptional regulator, MarR family  38.68 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4466  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120137  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  49.12 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  42.11 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3355  MarR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496446  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03440  transcriptional regulator, MarR family  36.26 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.495444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  36.84 
 
 		 261 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>