292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3979 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
154 aa  313  6e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 
153 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  38.69 
 
 
169 aa  97.4  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  39.66 
 
 
165 aa  91.3  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  36.92 
 
 
155 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  35.83 
 
 
149 aa  87.8  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  36.43 
 
 
161 aa  87  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  37.32 
 
 
153 aa  86.3  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 
173 aa  86.3  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  33.33 
 
 
149 aa  83.6  9e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0881  MarR family transcriptional regulator  41.14 
 
 
168 aa  82  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  34.53 
 
 
189 aa  80.5  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3523  transcriptional regulator, TrmB  31.33 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503632  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0643  transcriptional regulator, MarR family  37.82 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0797969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2959  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000427838 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2098  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0688139  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3355  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
175 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496446  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
154 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
185 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3128  regulatory protein, MarR  31.88 
 
 
204 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.537858  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1841  transcriptional regulator, TrmB  41.38 
 
 
148 aa  60.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100194  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 
148 aa  60.5  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  34.19 
 
 
185 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
152 aa  59.7  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 
176 aa  58.9  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9046  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393176  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7578  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 
162 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36750  transcriptional regulator  32.8 
 
 
158 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49551  normal  0.235126 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 
189 aa  57.4  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
157 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3813  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3332  transcriptional regulator, MarR family  31.69 
 
 
160 aa  55.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135407  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1519  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 
180 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0826678  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
136 aa  56.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  25.32 
 
 
167 aa  55.1  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 
172 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10950  transcriptional regulator  29.66 
 
 
175 aa  55.1  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279109  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  31.25 
 
 
147 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
148 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  23.68 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  26.62 
 
 
183 aa  51.6  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
164 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  27.46 
 
 
148 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  27.46 
 
 
148 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  27.46 
 
 
148 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  27.46 
 
 
148 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  27.46 
 
 
148 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  27.46 
 
 
148 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
164 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
169 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
183 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  38.82 
 
 
166 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  26.76 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  26.76 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  26.76 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
171 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37340  transcriptional regulator  34.21 
 
 
198 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.186615 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
171 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5345  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
164 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  29 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  45.59 
 
 
158 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
172 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
172 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
172 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
146 aa  48.1  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 
139 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
139 aa  48.1  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 
168 aa  47.8  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 
172 aa  47.8  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
172 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
172 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
168 aa  47.4  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
172 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
172 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>