295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1523 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1523  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 176 aa  362  1e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.7127  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2360  transcriptional regulator, MarR family  36.62 
 
 		 160 aa  95.9  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00354058  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 158 aa  62  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1596  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2243  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355574  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1494  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.386446  hitchhiker  0.00719492 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0419  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2079  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.742687 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 206 aa  52  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 139 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 164 aa  51.6  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 139 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 139 aa  50.8  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 150 aa  50.8  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 139 aa  50.8  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 150 aa  50.8  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 167 aa  50.8  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3337  transcriptional repressor MprA  28.09 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 143 aa  50.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 143 aa  50.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3200  transcriptional repressor MprA  28.09 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3458  transcriptional repressor MprA  28.09 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 148 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 148 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 142 aa  49.3  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 144 aa  48.9  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 140 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 165 aa  48.9  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  21.98 
 
 		 152 aa  48.9  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 148 aa  47.8  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  30.14 
 
 		 146 aa  47.8  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 148 aa  47.8  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0883  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 154 aa  47.4  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.736004  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  40.68 
 
 		 160 aa  47.8  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 145 aa  47.8  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0983  MarR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3754  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.852787  normal  0.231032 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  33.85 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0283  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  39.39 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  22.3 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  27.08 
 
 		 150 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 147 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  42 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 184 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2770  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  24.72 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 180 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 140 aa  45.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 138 aa  45.8  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 152 aa  45.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6072  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 148 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  26 
 
 		 167 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0978  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 310 aa  45.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.154037  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3725  regulatory protein MarR  30 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 151 aa  45.1  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1696  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 163 aa  45.1  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 174 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  37.66 
 
 		 160 aa  45.4  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 152 aa  45.1  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0284  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 174 aa  45.1  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141627  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 151 aa  45.1  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23740  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 159 aa  45.1  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 194 aa  44.7  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  29.13 
 
 		 177 aa  45.1  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 173 aa  45.1  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 194 aa  44.7  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 190 aa  44.7  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  25.83 
 
 		 140 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 148 aa  44.7  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  25.83 
 
 		 139 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>