More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0663 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
165 aa  341  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  38.53 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 
154 aa  77  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  41.67 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 
201 aa  70.9  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  41 
 
 
172 aa  70.5  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  41 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  34.9 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  36.04 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2777  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.392987 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
173 aa  67.4  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33630  transcriptional regulator  30.99 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120194  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 
165 aa  62.4  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 
174 aa  62.4  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 
188 aa  62  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 
175 aa  60.5  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  36.26 
 
 
161 aa  60.5  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1657  transcriptional regulator, MarR family  38.68 
 
 
157 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384015  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 
152 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  35.64 
 
 
165 aa  58.9  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1861  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 
174 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172751  normal  0.486159 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
147 aa  58.9  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  34.51 
 
 
169 aa  58.5  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
329 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
144 aa  57.8  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
159 aa  57.8  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
151 aa  57.4  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
151 aa  57.4  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
151 aa  57.4  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
165 aa  56.6  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
170 aa  57  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 
149 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
182 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 
161 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
161 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
127 aa  54.7  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
161 aa  54.3  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
161 aa  54.3  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
161 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
161 aa  54.3  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
138 aa  54.3  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  35.92 
 
 
140 aa  54.3  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 
189 aa  53.9  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
173 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  27.42 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 
157 aa  52.4  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  27.05 
 
 
149 aa  52.4  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4091  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 
161 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
159 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  35.85 
 
 
157 aa  52  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0910  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
176 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236829  normal  0.0112951 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
155 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
145 aa  52  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0044  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
193 aa  52  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 
168 aa  51.6  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
146 aa  51.6  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 
153 aa  51.6  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
161 aa  51.6  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  31.37 
 
 
162 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
142 aa  51.2  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  27.92 
 
 
159 aa  51.2  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 
175 aa  51.2  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
165 aa  50.8  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 
147 aa  51.2  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
336 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  28.17 
 
 
171 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0789  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
161 aa  50.4  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  44.44 
 
 
171 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 
142 aa  50.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1623  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.347087  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  44.78 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  25.77 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  33 
 
 
147 aa  50.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2025  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 
193 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>