More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2651 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
156 aa  309  1e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  51.95 
 
 
174 aa  159  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  49.35 
 
 
173 aa  159  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  51.3 
 
 
181 aa  157  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  47.77 
 
 
159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  52.35 
 
 
162 aa  148  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  48.08 
 
 
158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  45.51 
 
 
158 aa  142  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  44.16 
 
 
158 aa  142  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  44.16 
 
 
165 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  44.16 
 
 
165 aa  142  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  44.23 
 
 
167 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  44.81 
 
 
157 aa  135  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  42.21 
 
 
158 aa  135  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  44.81 
 
 
157 aa  135  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  48.7 
 
 
167 aa  135  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  42.21 
 
 
158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  42.21 
 
 
158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  42.21 
 
 
158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  42.21 
 
 
161 aa  134  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  42.21 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  45.52 
 
 
191 aa  131  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  45.22 
 
 
160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  46.94 
 
 
182 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
158 aa  128  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  42.21 
 
 
160 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
167 aa  126  9.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  44.29 
 
 
142 aa  122  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  39.35 
 
 
161 aa  118  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  41.5 
 
 
148 aa  117  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  42.54 
 
 
135 aa  117  7e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  41.84 
 
 
162 aa  107  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
159 aa  105  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  34.69 
 
 
187 aa  93.6  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  36.57 
 
 
177 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
170 aa  89  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
154 aa  87  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 
177 aa  80.9  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  36.97 
 
 
157 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  36.97 
 
 
157 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34950  MarR family regulatory protein  39.39 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
168 aa  77.4  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2954  MarR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0252271 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  31.47 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  32.37 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  43.66 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 
172 aa  63.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 
157 aa  63.5  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  37.65 
 
 
153 aa  62  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 
178 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
151 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0284  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
174 aa  61.2  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141627  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
150 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2248  transcriptional regulator, TrmB  37.11 
 
 
154 aa  61.2  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
153 aa  60.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
180 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  24.65 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
151 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  24.24 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0369  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  34.92 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  26.47 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 
180 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  24.24 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  27.17 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
162 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  27.17 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
155 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
151 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  32.12 
 
 
163 aa  57.4  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03440  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 
169 aa  57.4  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.495444  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 
159 aa  57.4  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
191 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 
191 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
198 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
146 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
150 aa  57  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  28.7 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
150 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 
149 aa  57  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>