More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6090 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 155 aa  309  7.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  36.92 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  32.56 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  35.83 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2959  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000427838 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  38.32 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0881  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  34.92 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  35.2 
 
 		 169 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0643  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0797969 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  30.25 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3523  transcriptional regulator, TrmB  30.23 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  37.37 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7578  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1519  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 		 180 aa  57.4  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0826678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  36.44 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1841  transcriptional regulator, TrmB  29.66 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100194  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  26.97 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2098  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0688139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  40.85 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  36.57 
 
 		 318 aa  55.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  40.28 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.19 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 195 aa  53.9  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2650  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038621  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 171 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 189 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  35.94 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5817  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 146 aa  51.2  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.127726 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 171 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 154 aa  50.8  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 156 aa  50.8  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3355  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 175 aa  50.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496446  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 163 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01154  transcriptional regulator MarR family  35 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.819197  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  44.07 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  40.79 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  23.53 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>