More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3915 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  305  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  36.5 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36750  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49551  normal  0.235126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  36.84 
 
 		 185 aa  72  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 185 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2662  transcriptional regulator, MarR family  39.05 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0115  regulatory protein, MarR  36.54 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0627652  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04490  MarR family regulator  32.76 
 
 		 180 aa  60.5  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  35.79 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3332  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135407  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 184 aa  57  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 		 176 aa  57  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  34.45 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15440  MarR family regulator  34.58 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00511304  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  29.87 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  40.26 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3541  transcriptional regulator, Mar family  32.11 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 		 173 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  31.54 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 168 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 137 aa  50.4  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  34.07 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  39.47 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7578  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 138 aa  48.5  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  36.54 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 139 aa  48.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  36.14 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  27.88 
 
 		 287 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  54.35 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 185 aa  47.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 172 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 181 aa  47.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 172 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 172 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 177 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 163 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 163 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  44.64 
 
 		 170 aa  47  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 172 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 172 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 172 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 172 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2959  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000427838 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37340  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 198 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.186615 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5345  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 166 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3813  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 167 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23740  transcriptional regulator  34.19 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>