More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_774 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_774  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 171 aa  349  1e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.489268  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0789  MarR family transcriptional regulator  88.2 
 
 		 161 aa  271  3e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0871  MarR family transcriptional regulator  82.61 
 
 		 161 aa  259  2e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0438869  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  36.96 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  41.33 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  30.84 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  38.54 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3523  transcriptional regulator, TrmB  33.67 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503632  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  42.25 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.83 
 
 		 310 aa  54.3  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  39.71 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  32.53 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  40.28 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  32.53 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1698  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.510269 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0796  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.517671  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7578  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3956  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 140 aa  52.4  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 203 aa  52.4  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3170  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 		 151 aa  52  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  hitchhiker  0.0000000757485 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  27.45 
 
 		 149 aa  52  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 139 aa  52  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 		 178 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 148 aa  51.6  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  32.32 
 
 		 140 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 178 aa  51.2  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 		 194 aa  50.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 152 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 148 aa  50.8  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 		 194 aa  50.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 161 aa  50.8  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 161 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 161 aa  50.8  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 		 156 aa  50.8  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 		 161 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  23.13 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>