More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3170 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3170  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 151 aa  293  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  hitchhiker  0.0000000757485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  52.67 
 
 		 168 aa  138  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  39.86 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1698  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.510269 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  37.61 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4007  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  38 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  38 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 174 aa  57  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  37.89 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  32.52 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  30.65 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  25.96 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0840  transcriptional regulator, MarR family  38.55 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  34.86 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 176 aa  53.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 176 aa  53.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  36.75 
 
 		 147 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  36.75 
 
 		 147 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  34.44 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  36.36 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  33.33 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  37.62 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0843  regulatory protein MarR  39.73 
 
 		 178 aa  51.6  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  29.47 
 
 		 178 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 152 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  32 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 152 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  32 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 155 aa  51.2  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 152 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 152 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1290  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 172 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000103671  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0365  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1701  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000687846 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  39.19 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7500  hypothetical protein  26.87 
 
 		 190 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7490  hypothetical protein  26.4 
 
 		 190 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 157 aa  50.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 147 aa  50.1  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>