295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3717 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  100 
 
 
310 aa  620  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  52.3 
 
 
304 aa  297  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  50.66 
 
 
299 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  46.56 
 
 
305 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  46.1 
 
 
309 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  47.68 
 
 
326 aa  264  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  44.7 
 
 
312 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  48.48 
 
 
314 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  44.08 
 
 
307 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  46 
 
 
315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  44.78 
 
 
314 aa  251  9.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  45.48 
 
 
309 aa  248  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
316 aa  247  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  46.05 
 
 
320 aa  245  8e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  45.05 
 
 
322 aa  242  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  43.43 
 
 
308 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
310 aa  241  9e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  42 
 
 
305 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  41.67 
 
 
305 aa  238  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
307 aa  232  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4157  MarR family transcriptional regulator  41.61 
 
 
308 aa  229  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.963186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0559  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  41.91 
 
 
308 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0978  MarR family transcriptional regulator  37.05 
 
 
310 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.154037  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  30.35 
 
 
306 aa  180  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  36.96 
 
 
318 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2115  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37.33 
 
 
317 aa  159  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4388  GCN5-related N-acetyltransferase  52.38 
 
 
163 aa  159  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  51.27 
 
 
162 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3649  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.12 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00196269  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
325 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  39.1 
 
 
161 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0752  acetyltransferase  39.1 
 
 
161 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  41.78 
 
 
161 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.036557 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  27.85 
 
 
326 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
321 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  27.85 
 
 
326 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  27.85 
 
 
326 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.92 
 
 
325 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2471  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
321 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.536093  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  27.39 
 
 
326 aa  99.4  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
326 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
336 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  27.1 
 
 
313 aa  94  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 
143 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  33.11 
 
 
848 aa  89.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  30.33 
 
 
290 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2004  transcriptional regulator  38.98 
 
 
142 aa  88.6  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.112591  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  31.37 
 
 
166 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499326  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  23.47 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5083  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.76 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  23.29 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8209  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.21 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2131  GCN5-related N-acetyltransferase  32.3 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649673  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  22.76 
 
 
352 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  23.65 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  23.65 
 
 
349 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  23.47 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  23.47 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 
337 aa  77  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  23.31 
 
 
349 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.68 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2501  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.62 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  23.65 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  22.46 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  22.03 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  24.15 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  22.3 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2226  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.03 
 
 
291 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326568  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  23.41 
 
 
307 aa  62.8  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  20.57 
 
 
322 aa  62  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  21.71 
 
 
313 aa  60.8  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4186  GCN5-related N-acetyltransferase  42.7 
 
 
168 aa  60.1  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  21.09 
 
 
319 aa  59.3  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  21.09 
 
 
319 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1054  putative acetyltransferase  35.56 
 
 
164 aa  58.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  21.3 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1783  acetyltransferase  33.06 
 
 
153 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.874564  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  33.86 
 
 
162 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  31.67 
 
 
212 aa  54.3  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377993  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2106  GCN5-related N-acetyltransferase  23.47 
 
 
327 aa  53.9  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115072 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3178  GCN5-related N-acetyltransferase  27.19 
 
 
173 aa  53.9  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  30.68 
 
 
160 aa  53.5  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
160 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  34.19 
 
 
167 aa  52.4  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08700  acetyltransferase  43.28 
 
 
166 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  28.47 
 
 
161 aa  51.6  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
140 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
140 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  32.76 
 
 
167 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4677  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
168 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068421 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
161 aa  50.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  33.02 
 
 
162 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1530  GCN5-related N-acetyltransferase  28.08 
 
 
157 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.839822  normal  0.716536 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0935  acetyltransferase  31.78 
 
 
173 aa  50.1  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000592178  normal  0.287398 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3318  GCN5-related N-acetyltransferase  34.18 
 
 
157 aa  49.7  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0859673 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3727  GCN5-related N-acetyltransferase  32.53 
 
 
167 aa  49.7  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>