More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2500 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 178 aa  335  9.999999999999999e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  57.65 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  52.15 
 
 		 175 aa  140  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  47.65 
 
 		 189 aa  122  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  48.59 
 
 		 166 aa  117  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3695  transcriptional regulator, MarR family  48.1 
 
 		 162 aa  111  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000171458  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  44.59 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2643  MarR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2688  MarR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2672  MarR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 176 aa  98.2  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  44.03 
 
 		 176 aa  95.9  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 147 aa  92  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  41.22 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  37.62 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 152 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 152 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 152 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  38.61 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  38.61 
 
 		 152 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  38.61 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 158 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3861  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 141 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.640191 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 172 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  37.76 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 172 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0013  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 219 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  33.59 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 173 aa  52.8  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  31.9 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 152 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  30.64 
 
 		 203 aa  52.4  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 160 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  40.58 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 171 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 137 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 140 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 171 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 146 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 149 aa  52  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 146 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0369  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 155 aa  52  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 177 aa  52  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  27.14 
 
 		 154 aa  52  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 150 aa  51.6  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  38.14 
 
 		 150 aa  51.6  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 		 138 aa  51.6  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 152 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 142 aa  51.6  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 159 aa  51.6  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 146 aa  51.2  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0893  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 148 aa  51.2  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6072  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 148 aa  51.2  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 149 aa  51.2  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 171 aa  51.2  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2132  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 148 aa  50.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151362  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  35.05 
 
 		 178 aa  50.8  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 322 aa  50.8  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2744  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 148 aa  50.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  39.02 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 147 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0843  regulatory protein MarR  27.42 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 340 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 326 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06415  transcriptional regulator marR family protein  34.21 
 
 		 139 aa  50.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  38.89 
 
 		 157 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>