More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3946 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 194 aa  394  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 194 aa  394  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  87.3 
 
 		 201 aa  330  6e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  76.88 
 
 		 203 aa  266  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  58.39 
 
 		 175 aa  187  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  59.21 
 
 		 162 aa  187  7e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 186 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  47.19 
 
 		 187 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  47.7 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  54 
 
 		 167 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 168 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  53.79 
 
 		 162 aa  160  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  53.06 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  51.7 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  48.75 
 
 		 161 aa  158  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 163 aa  144  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 204 aa  121  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  43.66 
 
 		 186 aa  121  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 161 aa  117  9e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 167 aa  111  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 		 145 aa  101  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2276  MarR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 158 aa  90.9  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 169 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  45.71 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  42.22 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  37.89 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  37.89 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  37.89 
 
 		 157 aa  62  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  29.93 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  34.71 
 
 		 152 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 166 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 147 aa  60.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  46.48 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  37.89 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  46.48 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  31.9 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  39.39 
 
 		 164 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 164 aa  57  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  36.43 
 
 		 163 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  41.03 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  28.83 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  40.79 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  36.63 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4909  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 136 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  48.48 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 180 aa  53.9  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  45.59 
 
 		 160 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5284  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 136 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 137 aa  53.9  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  29.51 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 184 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 140 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  41.54 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 		 137 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>