245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03391 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  276  6e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  86.13 
 
 		 140 aa  246  9e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0180  MarR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 139 aa  142  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2268  regulatory protein, MarR  34.21 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 		 159 aa  57  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  41.03 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  41.03 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  33.05 
 
 		 163 aa  53.5  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  44.62 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  42.19 
 
 		 201 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0382  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  32.61 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1336  MarR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  38.1 
 
 		 174 aa  50.4  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  44.83 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  41.24 
 
 		 283 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2118  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 		 142 aa  48.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 203 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  33.71 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  26.19 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1533  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202577  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  29.25 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 184 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 171 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  31.82 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0403  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 186 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  30.36 
 
 		 171 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 164 aa  47  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1655  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  43.1 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5333  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.828951 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  31.54 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 		 301 aa  46.2  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  31.54 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  31.54 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  32.37 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  31.54 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3531  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179982  normal  0.511756 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3041  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  31.54 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  36.99 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  34.71 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  31.54 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  31.54 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3395  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  34.71 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  34.71 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  34.71 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  34.71 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8691  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  38.81 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  29.21 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  23.93 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  31.54 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>