61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0403 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0403  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  316  9e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2028  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 156 aa  50.4  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.400753  hitchhiker  0.000427569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  37.84 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1178  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  34.25 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 		 142 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3261  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 		 142 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  36.49 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1958  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 258 aa  44.7  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 168 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0983  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 178 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3035  regulatory protein, MarR  32.65 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  26.98 
 
 		 220 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0501  transcriptional regulator  30.14 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  36.92 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2109  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  49.09 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  42.31 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  34.02 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 152 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 153 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2500  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.394742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  38.89 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 142 aa  41.2  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1265  transcriptional regulator, MarR family  29.51 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000976075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  25.53 
 
 		 141 aa  41.2  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 193 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  33.33 
 
 		 168 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0782  putative helix-turn-helix transcriptional regulator  21.54 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0187  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 167 aa  40.8  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  42.59 
 
 		 142 aa  40.4  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>