205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0180 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0180  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 139 aa  278  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  52.63 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  52.63 
 
 		 140 aa  141  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2268  regulatory protein, MarR  34.67 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2254  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0799585  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  30.63 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2559  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 179 aa  53.5  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  36.25 
 
 		 163 aa  52  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  28.44 
 
 		 197 aa  52  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  39.13 
 
 		 171 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4209  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 187 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  32.79 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  30.58 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  32.79 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  30.58 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  30.58 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  37.08 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1533  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202577  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 184 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  33.75 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  29.17 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0763  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 159 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 159 aa  47.4  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4184  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 174 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 162 aa  47  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  29.17 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  29.17 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  29.17 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  29.17 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  29.17 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2306  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000137668  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  29.17 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  28.1 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 193 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  43.86 
 
 		 161 aa  45.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  29.17 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  27.96 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 184 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  43.1 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  33.01 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  36.47 
 
 		 174 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 172 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 208 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 164 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 164 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 171 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 164 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 164 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 164 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 164 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 171 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 164 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 156 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  32.53 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 183 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 181 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 411 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  26.55 
 
 		 182 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0190  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 172 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  28.74 
 
 		 160 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  36.23 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  37.14 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  28.89 
 
 		 160 aa  43.5  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5309  Transcriptional regulator  33.04 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00683555  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  28.1 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  32.99 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  32.99 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>