More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0389 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  317  3e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  91.78 
 
 		 146 aa  274  4e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  36.54 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  36.84 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  30.22 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  25.44 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  30.69 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 171 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0180  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2575  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000352452  normal  0.108495 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  32.08 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 172 aa  51.6  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 220 aa  52.4  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  26.05 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  26.06 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 181 aa  51.2  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  31.63 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  30.48 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 139 aa  51.2  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 171 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2560  transcriptional regulator, MarR family  27.36 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  27.45 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  27.36 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  28.44 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2306  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000137668  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4895  transcriptional regulator, MarR family  38.55 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  24.56 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  26.53 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  29.9 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.763682  normal  0.971845 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  26.53 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  24.29 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3701  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.156019 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  26.53 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1175  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  29.9 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.051458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1059  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  29.9 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  22.79 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1195  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  29.9 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.711605 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1164  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  29.9 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0126682  normal  0.965749 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  24.29 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0142  MarR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  26.45 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  27.06 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  30.38 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  31.03 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1846  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 146 aa  48.5  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2106  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 		 327 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115072 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 152 aa  48.1  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  25.24 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  27.05 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 155 aa  47.4  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  22.12 
 
 		 149 aa  47.4  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  25.66 
 
 		 146 aa  47.4  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0803  transcriptional regulator, MarR family protein  29.76 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 138 aa  47.4  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06185  transcriptional regulator, marR family protein  23.58 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>