161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2575 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2575  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 139 aa  280  4.0000000000000003e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000352452  normal  0.108495 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2560  transcriptional regulator, MarR family  69.57 
 
 		 139 aa  204  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0096  MarR family transcriptional regulator  60.14 
 
 		 139 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1533  MarR family transcriptional regulator  61.59 
 
 		 139 aa  174  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202577  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0142  MarR family transcriptional regulator  55.07 
 
 		 139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  31.62 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  29.85 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  38.39 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  32.54 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  29.01 
 
 		 147 aa  52  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 150 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 143 aa  50.4  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  24.63 
 
 		 137 aa  48.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1670  MarR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 182 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000203174  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3505  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000513952 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  28.44 
 
 		 159 aa  47  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 152 aa  47  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 157 aa  47  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 160 aa  47  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  26.04 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  26.04 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  26.04 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  26.04 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  23.85 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  24.09 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  28.7 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  27.5 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3956  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  28.89 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  27.72 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 166 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  23.48 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  26.58 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  27.2 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  32.26 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  28.85 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  27.2 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4909  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 183 aa  44.3  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  22.86 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2666  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  21.6 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0095  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  23.77 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 174 aa  42.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2400  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  24.11 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  31.67 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4256  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0931  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 168 aa  42  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>