More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1594 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  48.94 
 
 
148 aa  159  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
152 aa  147  5e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 
144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  41.61 
 
 
144 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  34.01 
 
 
154 aa  105  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
154 aa  97.8  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  30.26 
 
 
157 aa  97.1  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 
156 aa  87.8  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  29.69 
 
 
161 aa  77.4  0.00000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0802  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.495252  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  27.48 
 
 
135 aa  67  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0814  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392859  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  28.17 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0708  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0820  transcriptional regulator, MarR family  28.23 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9124400000000003e-54 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0652  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0895094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0744  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0751713  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0820  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275641  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0651  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 
146 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.243525  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0899  transcriptional regulator, MarR family  28.23 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0629  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000664283  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
220 aa  59.7  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  31.07 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4529  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.531118  normal  0.188029 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  28.76 
 
 
161 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
168 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  24.81 
 
 
138 aa  58.9  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
149 aa  58.9  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  27.5 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
140 aa  58.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
171 aa  57.8  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 
142 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
139 aa  57.8  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 
142 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2550  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 
152 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.313861 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2555  MarR family transcriptional regulator  21.43 
 
 
149 aa  57.4  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242477  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
139 aa  57  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 
220 aa  55.1  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  25.58 
 
 
138 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
164 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  29.6 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0082  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
174 aa  52  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
145 aa  51.6  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  37.33 
 
 
157 aa  51.2  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1832  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
163 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
163 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
163 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  25.18 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
164 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0343  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 
157 aa  49.7  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
163 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  29.11 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  26.56 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  28.57 
 
 
177 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
172 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0871  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
161 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0438869  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 
137 aa  48.9  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 
171 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
163 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  24.18 
 
 
161 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0096  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 
139 aa  48.9  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1150  MarR family transcriptional regulator  21.36 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.838815  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2560  transcriptional regulator, MarR family  27.42 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  24.55 
 
 
139 aa  48.5  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  28.57 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
162 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
162 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>