More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1437 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
138 aa  279  9e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  68.12 
 
 
138 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  59.85 
 
 
154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  59.85 
 
 
153 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  59.85 
 
 
149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  59.85 
 
 
168 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  59.85 
 
 
159 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  59.85 
 
 
159 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  59.85 
 
 
153 aa  164  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  59.85 
 
 
153 aa  164  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  59.85 
 
 
153 aa  164  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  56.82 
 
 
139 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  56.93 
 
 
139 aa  160  6e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  55.47 
 
 
139 aa  159  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
137 aa  150  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  57.25 
 
 
140 aa  142  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  59.85 
 
 
137 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  50 
 
 
135 aa  135  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  47.1 
 
 
138 aa  134  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  55.07 
 
 
138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  46.21 
 
 
142 aa  124  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1347  MarR family transcriptional regulator  40.77 
 
 
142 aa  93.6  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0186903  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 
156 aa  77  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 
220 aa  67.8  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 
220 aa  64.7  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  42 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  33.64 
 
 
161 aa  63.5  0.0000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
152 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
152 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
152 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
152 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  41.89 
 
 
152 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  41.89 
 
 
152 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 
161 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
161 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
161 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
161 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
152 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  41.89 
 
 
152 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
162 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
141 aa  60.8  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  41.89 
 
 
152 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
146 aa  60.5  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 
140 aa  58.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
157 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
161 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2555  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
149 aa  57.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242477  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
153 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  37.61 
 
 
157 aa  57.4  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
204 aa  57  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
136 aa  57  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  33.33 
 
 
162 aa  57  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
148 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  41.8 
 
 
171 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  40.24 
 
 
175 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 
167 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  45.83 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  45.83 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  44.16 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 
159 aa  55.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3565  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
165 aa  55.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  29.57 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 
171 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1832  MarR family transcriptional regulator  24.07 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  30.85 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  38.96 
 
 
179 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 
156 aa  54.7  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  22.63 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
173 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  29.91 
 
 
141 aa  54.3  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
149 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>