More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1347 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1347  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
142 aa  282  1.0000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0186903  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  54.2 
 
 
139 aa  124  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  39.69 
 
 
139 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  45.38 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  40.77 
 
 
138 aa  110  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
139 aa  108  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
139 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
153 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  41.79 
 
 
138 aa  104  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  39.53 
 
 
135 aa  104  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
154 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
137 aa  103  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  36.64 
 
 
138 aa  103  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
168 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
149 aa  103  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 
159 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 
159 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
153 aa  100  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
153 aa  100  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
153 aa  100  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 
142 aa  99.4  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  37.88 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  38.1 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 
156 aa  67  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  26.39 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2555  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
149 aa  60.8  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242477  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  27.91 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
161 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
165 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
173 aa  58.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  38.16 
 
 
189 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
160 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 
160 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
160 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 
160 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
160 aa  57.4  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
171 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
160 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 
144 aa  57.4  0.00000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  45.76 
 
 
163 aa  57  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  26.79 
 
 
148 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  26.79 
 
 
148 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
151 aa  57  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
160 aa  57  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 
153 aa  57  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  36.71 
 
 
159 aa  56.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
142 aa  55.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  25.89 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  25.89 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
162 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  23.94 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 
165 aa  55.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
145 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
145 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
158 aa  53.5  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  21.9 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  26.61 
 
 
178 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 
168 aa  52  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  31.82 
 
 
147 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  31.53 
 
 
174 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
150 aa  51.2  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
146 aa  51.2  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 
147 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
154 aa  50.1  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 
165 aa  50.4  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  25.47 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3065  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0826002 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
168 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1208  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00251951  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01757  hypothetical protein  29.81 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4274  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>