285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3132 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 165 aa  326  8e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  36 
 
 		 161 aa  93.6  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  39.66 
 
 		 154 aa  91.3  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  38.4 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  33.05 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  36.92 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  41.38 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 189 aa  73.9  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  31.29 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0881  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2098  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0688139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  35.83 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  33.75 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  34.86 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  29.75 
 
 		 183 aa  57.4  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10950  transcriptional regulator  34.35 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2959  transcriptional regulator, MarR family  27.46 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000427838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3355  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496446  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7578  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3523  transcriptional regulator, TrmB  26.85 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 145 aa  52  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 		 203 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  32.67 
 
 		 184 aa  51.2  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3128  regulatory protein, MarR  30.66 
 
 		 204 aa  50.8  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 156 aa  50.8  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37340  transcriptional regulator  28.7 
 
 		 198 aa  50.8  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.186615 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  26.67 
 
 		 138 aa  50.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  38.37 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  59.46 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  39.58 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 154 aa  48.5  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  25.37 
 
 		 176 aa  48.5  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  21.9 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 142 aa  48.1  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 164 aa  48.1  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0629  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000664283  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 164 aa  48.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 164 aa  48.1  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 164 aa  48.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 155 aa  48.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 164 aa  48.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 164 aa  48.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 164 aa  48.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 155 aa  47.8  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 169 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 156 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1639  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 		 161 aa  47.4  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 156 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1519  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 180 aa  47.8  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0826678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 156 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 140 aa  47.4  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 137 aa  47.4  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0643  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0797969 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  39.08 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  24.27 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4248  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15440  MarR family regulator  35.38 
 
 		 197 aa  46.2  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00511304  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  39.73 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  33.73 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  30.56 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0199  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  36.47 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  34.69 
 
 		 292 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  44.78 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0983  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>