More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1519 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1519  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
180 aa  345  2e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0826678  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  49.24 
 
 
157 aa  122  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 
153 aa  84.7  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  32.56 
 
 
149 aa  84.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2098  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
155 aa  84  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0688139  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3523  transcriptional regulator, TrmB  33.08 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503632  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  39.69 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0881  MarR family transcriptional regulator  41.13 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 
155 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0643  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0797969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2959  transcriptional regulator, MarR family  48.57 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000427838 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 
173 aa  67.8  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1841  transcriptional regulator, TrmB  42.86 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100194  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
165 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 
189 aa  61.6  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 
159 aa  59.3  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  28.16 
 
 
147 aa  58.9  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7578  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 
162 aa  57.8  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 
183 aa  56.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
185 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
138 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
136 aa  55.5  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  32.71 
 
 
149 aa  55.5  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  24.35 
 
 
189 aa  54.7  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  30.13 
 
 
185 aa  54.3  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  26.04 
 
 
168 aa  54.3  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36750  transcriptional regulator  32.7 
 
 
158 aa  53.9  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49551  normal  0.235126 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
164 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  37.18 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
147 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 
138 aa  52.8  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
153 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
173 aa  52  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23740  transcriptional regulator  32.8 
 
 
159 aa  52  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 
142 aa  52  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
161 aa  52  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
164 aa  52  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2768  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
143 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
167 aa  51.2  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  38.94 
 
 
157 aa  50.8  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
170 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
152 aa  50.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
178 aa  50.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
164 aa  50.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
139 aa  50.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
148 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 
150 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3064  transcriptional regulator  30.7 
 
 
159 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
138 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 
142 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
146 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
172 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
179 aa  48.9  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
151 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
151 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
143 aa  48.9  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
151 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3062  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 
173 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.455637  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
173 aa  48.5  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
157 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
168 aa  48.5  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
143 aa  48.5  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 
152 aa  48.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  28.45 
 
 
157 aa  48.1  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0044  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
193 aa  48.1  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
181 aa  48.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  36.99 
 
 
187 aa  48.1  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
165 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
165 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
150 aa  47.8  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 
181 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
165 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
165 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
165 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
165 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
165 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  33.33 
 
 
147 aa  47.8  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0883  transcriptional regulator, MarR family  26.24 
 
 
154 aa  47.8  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.736004  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
171 aa  47.8  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 
147 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2752  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
159 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 
150 aa  47.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  25.79 
 
 
176 aa  47  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  38.98 
 
 
157 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
167 aa  47.4  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
165 aa  47.4  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10480  putative transcriptional regulator  23.36 
 
 
140 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  38.98 
 
 
157 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
168 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
154 aa  47.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
155 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 
148 aa  47.4  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4466  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 
179 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120137  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  30.77 
 
 
154 aa  47  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>