More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0983 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0983  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  320  6e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1178  MarR family transcriptional regulator  70.25 
 
 		 159 aa  225  2e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  61.01 
 
 		 159 aa  202  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  38.39 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  35.63 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  36.45 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  28.67 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 150 aa  51.2  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 138 aa  51.2  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 152 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  24.82 
 
 		 140 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 148 aa  50.8  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 157 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 152 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 157 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  30.56 
 
 		 206 aa  50.8  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 157 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  24.82 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  25.96 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 185 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  33 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1494  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.386446  hitchhiker  0.00719492 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  29.7 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6961  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866356  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  24.26 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2469  transcriptional regulator, MarR family  26.27 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  24.26 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 		 189 aa  48.5  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  31.33 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  27.74 
 
 		 187 aa  48.5  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 214 aa  48.5  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 148 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3956  MarR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 148 aa  48.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  26.26 
 
 		 148 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  26.26 
 
 		 148 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  26.26 
 
 		 148 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 156 aa  48.1  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  26.26 
 
 		 148 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  32.53 
 
 		 163 aa  47.8  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 182 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 148 aa  47.8  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 148 aa  47.8  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  21.9 
 
 		 140 aa  47.8  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 148 aa  47.8  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 170 aa  47.8  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  22.79 
 
 		 166 aa  47.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 176 aa  47.4  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 142 aa  47.4  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  31.33 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  31.33 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1523  MarR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.7127  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  31.33 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  29.55 
 
 		 261 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>