More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2143 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 214 aa  427  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 191 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 172 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 172 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 172 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 172 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 172 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 172 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 172 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 158 aa  62  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 142 aa  61.2  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 164 aa  60.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  33.86 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  33.93 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  29.86 
 
 		 162 aa  57.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 148 aa  57.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 167 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 185 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  28.9 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 148 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1081  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 166 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103663 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  22.56 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  22.56 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  28.24 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  32 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 149 aa  54.7  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2028  transcriptional regulator, MarR family  35.53 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.400753  hitchhiker  0.000427569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5020  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 139 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 170 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 177 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 155 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 145 aa  53.9  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 181 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 157 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 166 aa  53.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 158 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 151 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0797  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 161 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 171 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 152 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 155 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 171 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 156 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 159 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  27.19 
 
 		 175 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 		 144 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 		 167 aa  52.8  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 142 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 154 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 155 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 145 aa  52.4  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 179 aa  52  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 167 aa  52  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 		 139 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4510  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 150 aa  52  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.88228  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 155 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 		 167 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1178  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 159 aa  51.6  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 161 aa  51.6  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 146 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>