253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4510 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4510  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  299  7.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.88228  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 159 aa  113  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  39.55 
 
 		 157 aa  96.3  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0109  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.701478  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  29.58 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  29.08 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  27.59 
 
 		 292 aa  53.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  28.8 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 169 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 155 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4794  putative MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 152 aa  50.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.717119  normal  0.755619 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 155 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  29.66 
 
 		 154 aa  50.8  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1224  transcriptional regulator, MarR family  26.76 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414695  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 154 aa  50.4  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0777  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0741  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 		 162 aa  50.4  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.476836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26770  transcriptional regulator  36 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.462965 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  26.45 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  26.45 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  29.84 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 143 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  36.47 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0017  MarR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 167 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  25.62 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 161 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  29.91 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  47.4  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 155 aa  47.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  29.51 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 206 aa  47  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 174 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 		 180 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  24.44 
 
 		 208 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  24.79 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0436  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0742867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  24.62 
 
 		 214 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  29.13 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  27.42 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 411 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  36.14 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 172 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  30.17 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 164 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  29.13 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1346  transcriptional regulator  31.31 
 
 		 203 aa  46.2  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.564639  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2462  MarR family transcriptional regulator  17.99 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  29.5 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  31.62 
 
 		 185 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  28.57 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  34.52 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>