More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0742 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  100 
 
 		 292 aa  599  1e-170  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  38.19 
 
 		 174 aa  86.7  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  36.63 
 
 		 145 aa  77.4  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  38.02 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  29.94 
 
 		 161 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 150 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 150 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1346  transcriptional regulator  28.4 
 
 		 203 aa  65.1  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.564639  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 150 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  43.08 
 
 		 153 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1458  regulatory protein  28.57 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  27.07 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 150 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 169 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 142 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 139 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  30.63 
 
 		 142 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  27.07 
 
 		 139 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 		 139 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 		 139 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 139 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 168 aa  58.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 165 aa  57.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 146 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 142 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 139 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 150 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  27.45 
 
 		 144 aa  55.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 173 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 157 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2140  regulatory protein, MarR  32.14 
 
 		 173 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2296  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 173 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 156 aa  54.7  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  29.84 
 
 		 146 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 		 140 aa  53.9  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 177 aa  53.9  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 139 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  26.4 
 
 		 144 aa  53.9  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 173 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 138 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 138 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 150 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  31.13 
 
 		 150 aa  53.5  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  31.13 
 
 		 150 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  26.8 
 
 		 138 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 161 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 150 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3151  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 193 aa  53.5  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 150 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 138 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 150 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 142 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 159 aa  53.5  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 174 aa  52.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4510  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 150 aa  53.1  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.88228  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 142 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 163 aa  52.8  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1920  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 233 aa  52.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  37.65 
 
 		 174 aa  52.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 152 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 153 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  27 
 
 		 155 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 		 157 aa  52  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 147 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 145 aa  51.6  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  34.74 
 
 		 157 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 154 aa  51.6  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  29.22 
 
 		 158 aa  50.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 150 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 135 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 139 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 147 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  23.89 
 
 		 161 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03142  putative OhrR transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  31.31 
 
 		 146 aa  50.8  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.946678  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 141 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 137 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 195 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 155 aa  50.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0786  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 155 aa  50.4  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0555365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>