More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03142 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03142  putative OhrR transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  100 
 
 		 146 aa  298  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.946678  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0100  MarR family transcriptional regulator  53.38 
 
 		 141 aa  148  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 161 aa  120  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 155 aa  111  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 165 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 165 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  42.98 
 
 		 165 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 165 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  44.35 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  39.39 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 144 aa  107  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  43.48 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 165 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  38.24 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  39.72 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 165 aa  104  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 147 aa  104  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 168 aa  103  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 149 aa  103  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 165 aa  102  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 155 aa  102  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  39.23 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  43.24 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 150 aa  100  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 151 aa  99.4  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  39.1 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  39.1 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 156 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  39.1 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  38.13 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  39.67 
 
 		 155 aa  98.6  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  39.85 
 
 		 167 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  39.1 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  39.85 
 
 		 150 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 151 aa  98.6  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  39.1 
 
 		 150 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 151 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0374  MarR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 140 aa  98.2  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00135193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  38.57 
 
 		 155 aa  98.2  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  38.89 
 
 		 157 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 160 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  36.21 
 
 		 154 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  36.21 
 
 		 154 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 153 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  38.6 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  34.27 
 
 		 162 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  37.5 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1032  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  38.35 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  37.78 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 151 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 171 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  35.29 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  35.29 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  35.29 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  36.07 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1208  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 162 aa  94.7  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 158 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 158 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  39.64 
 
 		 150 aa  94  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 150 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  38.17 
 
 		 157 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 150 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  37.07 
 
 		 150 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 150 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 150 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  37.17 
 
 		 166 aa  94  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0840  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 170 aa  93.6  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 151 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 150 aa  93.6  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 150 aa  93.2  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  44.33 
 
 		 158 aa  93.6  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 267 aa  93.2  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  40.88 
 
 		 171 aa  92  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  37.39 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 176 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 161 aa  91.7  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1770  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 155 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>