More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0374 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0374  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
140 aa  283  5e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00135193  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0840  transcriptional regulator, MarR family  72.14 
 
 
140 aa  209  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  46.56 
 
 
163 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  45.24 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  42.96 
 
 
143 aa  123  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  42.96 
 
 
152 aa  123  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  44.03 
 
 
165 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  44.03 
 
 
165 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  44.03 
 
 
165 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  42.54 
 
 
165 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  44.03 
 
 
165 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  41.79 
 
 
150 aa  121  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  44.78 
 
 
168 aa  121  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2621  MarR family transcriptional regulator  43.07 
 
 
154 aa  121  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276728  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  42.54 
 
 
165 aa  121  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  43.65 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  43.07 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
165 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 
165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  42.54 
 
 
141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  42.22 
 
 
152 aa  116  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  42.22 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
161 aa  114  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 
144 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1685  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 
196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.402727  normal  0.628244 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1648  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.575498  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2562  MarR family transcriptional regulator  42.54 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1663  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
162 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2695  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 
172 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.21037  hitchhiker  0.0000565476 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  40.3 
 
 
152 aa  108  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
166 aa  107  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3365  MarR family transcriptional regulator  39.57 
 
 
161 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.559351  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1597  MarR family transcriptional regulator  39.57 
 
 
160 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2248  transcriptional regulator, TrmB  39.84 
 
 
154 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1517  MarR family transcriptional regulator  40.83 
 
 
141 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.0147514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1584  MarR family transcriptional regulator  40.83 
 
 
141 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119163  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
151 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  36.29 
 
 
150 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
152 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  39.52 
 
 
166 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  37.9 
 
 
150 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
151 aa  105  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
150 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
146 aa  103  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
170 aa  104  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
157 aa  103  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  36.29 
 
 
150 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  36.29 
 
 
150 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  36.29 
 
 
150 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
159 aa  103  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  40.62 
 
 
148 aa  103  9e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  39.2 
 
 
153 aa  102  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  38.35 
 
 
157 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  38.52 
 
 
171 aa  102  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 
154 aa  101  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1032  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 
143 aa  101  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  36.51 
 
 
150 aa  101  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  36.51 
 
 
150 aa  101  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
150 aa  100  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
185 aa  100  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  38.89 
 
 
158 aa  100  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 
158 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  38.84 
 
 
150 aa  100  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
156 aa  100  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
150 aa  100  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  37.1 
 
 
162 aa  100  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  32.8 
 
 
154 aa  100  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  37.98 
 
 
158 aa  100  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 
154 aa  100  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  37.9 
 
 
150 aa  100  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
150 aa  100  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
150 aa  100  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  40.46 
 
 
145 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
150 aa  99.4  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  34.92 
 
 
150 aa  99.4  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  34.92 
 
 
150 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  39.32 
 
 
155 aa  100  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
150 aa  99.4  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
151 aa  99.4  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1208  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
143 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  37.6 
 
 
152 aa  98.6  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 
150 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 
151 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
154 aa  98.2  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03142  putative OhrR transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  43.36 
 
 
146 aa  98.2  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.946678  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 
159 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1770  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
155 aa  98.2  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  36.88 
 
 
143 aa  98.2  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  40.18 
 
 
161 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 
157 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 
161 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  39.09 
 
 
143 aa  97.4  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  39.47 
 
 
195 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  38.58 
 
 
153 aa  97.1  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  37.9 
 
 
146 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 
147 aa  97.1  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>