More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4001 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
149 aa  292  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  82.01 
 
 
150 aa  223  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  42.97 
 
 
161 aa  84.7  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
142 aa  84  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  39.31 
 
 
161 aa  72  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  38.05 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  37.5 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6078  transcriptional regulator, MarR family  40.34 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  39.25 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  42.16 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  41.09 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  39.16 
 
 
208 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6147  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
159 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.676081  normal  0.847722 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  40.22 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  36.03 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  38.52 
 
 
150 aa  60.5  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  41.84 
 
 
164 aa  60.8  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  35.95 
 
 
150 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  37.7 
 
 
144 aa  60.5  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7721  MarR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26770  transcriptional regulator  31.16 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.462965 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  42.53 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  42.53 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  42.53 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
149 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  37.4 
 
 
163 aa  58.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  38.82 
 
 
173 aa  58.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 
165 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6656  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  36.36 
 
 
138 aa  57.4  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5772  MarR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
159 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.94508 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6016  MarR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
159 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
155 aa  57  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5812  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
159 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697265  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6176  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
159 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.714929  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  35.19 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  29.06 
 
 
292 aa  56.6  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  44.74 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  44.74 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  44.74 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 
146 aa  55.1  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
159 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 
148 aa  53.5  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  36.64 
 
 
158 aa  53.9  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
144 aa  52.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  38.37 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  42.68 
 
 
187 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 
144 aa  52.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 
143 aa  52  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
173 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
150 aa  52  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2611  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
202 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  30.87 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  41.07 
 
 
170 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
143 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  41.07 
 
 
170 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  36.45 
 
 
163 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  30.87 
 
 
151 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 
157 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  40.28 
 
 
140 aa  51.6  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6622  transcriptional regulator, MarR family  39.76 
 
 
158 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  33.06 
 
 
261 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  41.67 
 
 
137 aa  51.2  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
143 aa  51.2  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
146 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  34.23 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  43.59 
 
 
166 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2774  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0670  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0654  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.536381  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0174  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.63734  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2305  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.885566  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0832  MarR family regulatory protein  39.44 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3581  MarR family transcriptional regulator  39.24 
 
 
160 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2385  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>