More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3782 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
150 aa  292  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  82.01 
 
 
149 aa  223  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  43.61 
 
 
161 aa  91.7  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
142 aa  86.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  39.01 
 
 
146 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  37.58 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  37.58 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  36.91 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  39.57 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  39.13 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6078  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
143 aa  67  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  35.54 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  34.46 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  39.25 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  35.46 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  35.62 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  36.89 
 
 
144 aa  61.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
139 aa  61.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  39.13 
 
 
153 aa  60.8  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
147 aa  60.8  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 
148 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  36.57 
 
 
151 aa  60.5  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
155 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  38.82 
 
 
173 aa  58.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
155 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  34.82 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7721  MarR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  36.36 
 
 
163 aa  58.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  33.33 
 
 
292 aa  57.4  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
143 aa  57  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6147  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.676081  normal  0.847722 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  36.61 
 
 
151 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 
159 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  39.64 
 
 
161 aa  55.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6656  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26770  transcriptional regulator  28.99 
 
 
143 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.462965 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  42.17 
 
 
187 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  32.54 
 
 
145 aa  54.3  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  39.17 
 
 
143 aa  53.9  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  44.87 
 
 
166 aa  53.9  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  36.72 
 
 
149 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 
174 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  34.51 
 
 
146 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
149 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5772  MarR family transcriptional regulator  39.76 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.94508 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
352 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5812  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697265  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0749  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 
181 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6016  MarR family transcriptional regulator  39.76 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6176  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.714929  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  40.2 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 
167 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 
187 aa  52  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
141 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 
138 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  40.7 
 
 
145 aa  51.6  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  26.8 
 
 
143 aa  51.2  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
170 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  35.54 
 
 
261 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  38.26 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  31.16 
 
 
168 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  46.27 
 
 
170 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 
144 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3405  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
162 aa  50.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34693  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
173 aa  50.4  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  33.06 
 
 
154 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  40.35 
 
 
170 aa  50.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  34.26 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  35.51 
 
 
163 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  28.23 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>