94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3405 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3405  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 162 aa  327  3e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34693  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2122  transcriptional regulator, MarR family  50.99 
 
 		 165 aa  141  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.772041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3541  transcriptional regulator, Mar family  40.19 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6002  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.431751  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1964  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  33.98 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 158 aa  48.5  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 145 aa  47.8  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  29.17 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1709  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592382  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2807  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  29.76 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0585  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 180 aa  45.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2306  transcriptional regulator, TrmB  35.71 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  28.42 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  26.77 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1045  MarR family transcriptional regulator  20.78 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.734934  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0958  MarR family transcriptional regulator  20.78 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0900  MarR family transcriptional regulator  20.78 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 205 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0861  MarR family transcriptional regulator  20.78 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1040  transcriptional regulator, MarR family  20.78 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69196e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1128  transcriptional regulator, MarR family  20.78 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0879  MarR family transcriptional regulator  20.78 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.544594  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  27.88 
 
 		 153 aa  44.3  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 201 aa  44.3  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 139 aa  44.3  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 143 aa  44.3  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 159 aa  44.3  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2650  transcriptional regulator, MarR family  23.53 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038621  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  37.18 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  32.22 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0871  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0438869  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 		 146 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  35.21 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2566  transcriptional regulator, MarR family  36.51 
 
 		 237 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal  0.11891 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  35.53 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4278  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 179 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00638818  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  31.47 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  24.78 
 
 		 175 aa  42  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1114  response regulator receiver protein  41.27 
 
 		 266 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  27.17 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  30.61 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  26.8 
 
 		 178 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 161 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  35.21 
 
 		 148 aa  41.6  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 161 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  32.93 
 
 		 170 aa  41.6  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 161 aa  41.6  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 161 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0810  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 184 aa  41.2  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300222  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 165 aa  41.2  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.59 
 
 		 325 aa  41.2  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 148 aa  40.8  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  31.62 
 
 		 185 aa  40.8  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 185 aa  40.8  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 151 aa  40.8  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 151 aa  40.8  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 151 aa  40.8  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 147 aa  40.8  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  31.25 
 
 		 157 aa  40.8  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  36.25 
 
 		 135 aa  40.8  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4565  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4961  transcriptional regulator, MarR family  29.47 
 
 		 192 aa  40.4  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0717313  normal  0.154952 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 153 aa  40.4  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2782  transcriptional regulator, MarR family  29.47 
 
 		 192 aa  40.4  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00307717  normal  0.0921189 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 168 aa  40.4  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3588  homoprotocatechuate degradation transcriptional regulator HpaR  32.31 
 
 		 164 aa  40.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.732711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>