243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3927 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 156 aa  309  7.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  49.35 
 
 		 148 aa  130  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  54.01 
 
 		 143 aa  124  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  52.14 
 
 		 141 aa  120  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  49.28 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  51.8 
 
 		 153 aa  117  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  51.08 
 
 		 143 aa  114  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  47.3 
 
 		 162 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  48.18 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  54.07 
 
 		 139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  50.36 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  47.95 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  46.43 
 
 		 151 aa  104  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  48.46 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  50.77 
 
 		 161 aa  99  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 144 aa  98.6  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  46 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 149 aa  98.2  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  45.93 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  47.45 
 
 		 146 aa  95.1  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 146 aa  94  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  45.59 
 
 		 145 aa  93.6  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  43.7 
 
 		 163 aa  90.9  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  45.19 
 
 		 163 aa  89  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 		 145 aa  83.6  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  37.58 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  40.6 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  43.12 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  40.32 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 161 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  39.82 
 
 		 175 aa  67  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  42.59 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  35.62 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6078  transcriptional regulator, MarR family  40.48 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1259  MarR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.518732 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1269  MarR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0728  transcriptional regulator, MarR family  38.69 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  41.77 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  34.82 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1242  MarR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474925  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  37.39 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  34.07 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  41.11 
 
 		 173 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  33.67 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5003  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  37.3 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0768  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 		 219 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.012772 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4560  MarR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 195 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000343036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 		 213 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  46.75 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>