188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5811 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 150 aa  302  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  87.33 
 
 		 150 aa  266  8e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5003  MarR family transcriptional regulator  75.84 
 
 		 150 aa  204  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  66.44 
 
 		 150 aa  186  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  61.19 
 
 		 150 aa  167  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  54.36 
 
 		 156 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  57.78 
 
 		 150 aa  160  8.000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  55.03 
 
 		 162 aa  150  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  55.03 
 
 		 162 aa  150  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  55.03 
 
 		 162 aa  150  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2402  transcriptional regulator, MarR family  57.93 
 
 		 150 aa  147  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 151 aa  85.9  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  38.79 
 
 		 175 aa  84.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 162 aa  84  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 147 aa  84.3  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  37.32 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  38.06 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  34.93 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 141 aa  72  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  31.79 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  29.85 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0378  transcriptional regulator, MarR family  37.12 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 173 aa  67  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  34.01 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  29.32 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  34.26 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  37.72 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  36.84 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0728  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3272  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 172 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  35.35 
 
 		 157 aa  50.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 167 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 167 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 167 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  32 
 
 		 163 aa  47.4  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 164 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1269  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  35.71 
 
 		 338 aa  47  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  29.36 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  31.43 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>