More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4203 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 161 aa  311  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  46.22 
 
 		 157 aa  97.4  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  43.61 
 
 		 150 aa  91.3  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 149 aa  85.1  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  44.23 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  41.48 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  36.03 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  39.09 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  37.27 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 208 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 143 aa  67  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 142 aa  67  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  36.19 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  38.81 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  42.22 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  38.58 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  38.53 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  36.08 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  42 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  35.88 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  36.22 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  41.82 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  38.53 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0863  transcriptional regulator, TrmB  37.76 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029609 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  45.07 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0763  MarR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  35.05 
 
 		 283 aa  54.7  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2985  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0529502  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0088  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0844  regulatory protein MarR  36.56 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0324688  normal  0.429878 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0070  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  37.11 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 219 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0213  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 270 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3344  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 270 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0070  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 212 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>