121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0070 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0070  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
212 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2985  MarR family transcriptional regulator  92.45 
 
 
212 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0529502  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0061  MarR family transcriptional regulator  91.51 
 
 
212 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0070  MarR family transcriptional regulator  92.45 
 
 
212 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0088  MarR family transcriptional regulator  92.45 
 
 
212 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0069  MarR family transcriptional regulator  91.51 
 
 
212 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373152  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3251  MarR family transcriptional regulator  91.04 
 
 
212 aa  394  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0213  MarR family transcriptional regulator  83.89 
 
 
270 aa  363  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3344  MarR family transcriptional regulator  83.89 
 
 
270 aa  363  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2918  MarR family transcriptional regulator  81.99 
 
 
213 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3392  MarR family transcriptional regulator  81.99 
 
 
270 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1624  MarR family transcriptional regulator  81.99 
 
 
270 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2977  MarR family transcriptional regulator  81.99 
 
 
270 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3929  transcriptional regulator, MarR family  77.73 
 
 
212 aa  338  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000837661  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3063  MarR family transcriptional regulator  77.25 
 
 
214 aa  338  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565179  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0003  MarR family transcriptional regulator  76.78 
 
 
212 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838682  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4012  MarR family transcriptional regulator  82.32 
 
 
200 aa  333  9e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4084  MarR family transcriptional regulator  82.32 
 
 
200 aa  333  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574763  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  44.5 
 
 
208 aa  158  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2109  MarR family transcriptional regulator  41.96 
 
 
145 aa  97.8  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  31.35 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4421  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 
197 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.636596  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2911  transcriptional regulator, MarR family  28.49 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233066  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0210  MarR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.133838 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4139  MarR family transcriptional regulator  25.65 
 
 
201 aa  71.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3267  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1858  MarR family transcriptional regulator  35.36 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.642234  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  27.57 
 
 
196 aa  64.3  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0504  transcriptional regulator, TrmB  30.46 
 
 
176 aa  61.6  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.21026 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1206  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 
206 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
146 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 
161 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
143 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0658  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
191 aa  52.8  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
150 aa  50.4  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1503  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
189 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.481743  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  30.77 
 
 
186 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
190 aa  48.9  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0565  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
189 aa  48.5  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
160 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
160 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 
135 aa  48.1  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
142 aa  48.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  31.88 
 
 
153 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 
156 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 
153 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5382  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 
157 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 
168 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
160 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1290  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 
172 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000103671  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 
153 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 
147 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  34.88 
 
 
171 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
152 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  38.53 
 
 
140 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1440  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 
140 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.462332  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3108  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
151 aa  46.6  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 
154 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
171 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
171 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1265  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 
163 aa  45.8  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000976075  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  27.78 
 
 
157 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 
201 aa  46.2  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
151 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2282  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 
152 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000450533 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  28.32 
 
 
146 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  36.36 
 
 
162 aa  45.4  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
146 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  43.06 
 
 
140 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  36.26 
 
 
146 aa  45.1  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 
174 aa  45.4  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
141 aa  45.1  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  35.56 
 
 
157 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
151 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
170 aa  44.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
208 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0124  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
148 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1927  transcriptional regulator, MarR family  29.14 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  23.36 
 
 
159 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2011  transcriptional regulator  32.86 
 
 
156 aa  43.9  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
151 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  31.34 
 
 
186 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
151 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  26 
 
 
159 aa  43.5  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0883  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 
154 aa  43.9  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.736004  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
151 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2960  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
180 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.726943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
151 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1921  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
190 aa  43.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
151 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
151 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
151 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4923  transcriptional regulator, MarR family  38.03 
 
 
138 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 
151 aa  43.5  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3846  transcriptional regulator, MarR family  38.03 
 
 
138 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
139 aa  42.7  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
173 aa  42.4  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 
158 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 
157 aa  42  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
158 aa  42.4  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>