More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5474 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
171 aa  335  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
171 aa  335  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
152 aa  294  4e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  79.73 
 
 
146 aa  223  7e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  77.03 
 
 
146 aa  214  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  71.15 
 
 
208 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  39.04 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  39.75 
 
 
161 aa  79  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
143 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  37.58 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  41.28 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  41.26 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  42.73 
 
 
147 aa  73.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  45.05 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  38.57 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  44.33 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  41.82 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  41.82 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  41.82 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  37.27 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  38.05 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  44.44 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  42.72 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  40.19 
 
 
146 aa  67  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  34.9 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  40 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
151 aa  62.4  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  44 
 
 
149 aa  62  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  33.79 
 
 
157 aa  60.8  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  39.83 
 
 
159 aa  60.8  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  37.42 
 
 
158 aa  60.8  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  36.69 
 
 
145 aa  60.8  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  39.05 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 
143 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
147 aa  59.7  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  42.57 
 
 
161 aa  58.9  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  39.25 
 
 
163 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  42.59 
 
 
151 aa  59.3  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  37.19 
 
 
150 aa  58.9  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  32.62 
 
 
149 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  41.28 
 
 
149 aa  58.9  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  35.4 
 
 
154 aa  58.5  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  40.37 
 
 
144 aa  58.2  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
155 aa  57.8  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
151 aa  57.4  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 
144 aa  57  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 
173 aa  57  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 
175 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  42.99 
 
 
137 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
144 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 
159 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  37.4 
 
 
147 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  40.86 
 
 
127 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6078  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
143 aa  55.1  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 
152 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
156 aa  55.1  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
152 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 
152 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
150 aa  54.3  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
152 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 
156 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  30.14 
 
 
165 aa  54.3  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 
145 aa  54.3  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
151 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
152 aa  53.9  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0763  MarR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124951  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4248  transcriptional regulator, MarR family  43.9 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 
152 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
139 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 
164 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
172 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 
162 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  36.61 
 
 
214 aa  53.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  31.13 
 
 
149 aa  52.4  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
178 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
143 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
143 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  31.19 
 
 
135 aa  52.4  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
143 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
159 aa  52  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 
159 aa  52  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  38.14 
 
 
143 aa  51.6  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  39 
 
 
143 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
139 aa  51.6  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 
153 aa  51.2  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
147 aa  51.2  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  28.07 
 
 
147 aa  51.2  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>