291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2302 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
139 aa  274  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  75 
 
 
144 aa  210  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  64.71 
 
 
144 aa  161  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  64.71 
 
 
144 aa  161  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  64.71 
 
 
144 aa  161  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  56.06 
 
 
147 aa  140  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  56.3 
 
 
148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  44.8 
 
 
146 aa  111  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
168 aa  77.4  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
175 aa  73.9  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  38.52 
 
 
140 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  35.65 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3350  transcriptional regulator, MarR family  41.23 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0764351  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4000  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.869888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  44.79 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5196  transcriptional regulator, MarR family  40.87 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  33.61 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0875  MarR family transcriptional regulator  40.87 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.445474 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4639  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 
186 aa  63.9  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3949  transcriptional regulatory protein  36.67 
 
 
179 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4686  MarR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
168 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000388035  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 
128 aa  60.1  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5060  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.391119  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3957  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
165 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432771  normal  0.0893513 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0356  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
193 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 
162 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4190  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  41.24 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  42.86 
 
 
157 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1768  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
151 aa  54.7  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 
140 aa  53.5  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
171 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
171 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 
140 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  46.27 
 
 
158 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0763  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124951  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8638  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 
159 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.280895  normal  0.673509 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  44.12 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6436  transcriptional regulator, MarR family  36.52 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.408457 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2118  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  41.38 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
173 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  40.23 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  46.15 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  43.86 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  32.69 
 
 
162 aa  48.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17310  regulatory protein, MarR family  27.73 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  43.86 
 
 
163 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
167 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  38.16 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
167 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
168 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
160 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  32.93 
 
 
164 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 
161 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
167 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
167 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  39.62 
 
 
142 aa  47.4  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8732  hypothetical protein  36.56 
 
 
139 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 
158 aa  47.4  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  29.81 
 
 
174 aa  47.4  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  41.82 
 
 
140 aa  47  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
147 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
208 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
143 aa  47  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  39.73 
 
 
171 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  39.34 
 
 
137 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  40.58 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
155 aa  46.2  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>