72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1768 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1768  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
151 aa  307  4e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0282  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
157 aa  92  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.486948  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  30.15 
 
 
162 aa  79  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17310  regulatory protein, MarR family  26.77 
 
 
135 aa  61.6  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  32.26 
 
 
156 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 
151 aa  59.7  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2469  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  25.88 
 
 
150 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2118  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 
151 aa  50.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8638  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 
159 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.280895  normal  0.673509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
168 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 
151 aa  47.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  23.89 
 
 
151 aa  47.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4794  putative MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
152 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.717119  normal  0.755619 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0524  transcriptional regulator  23.46 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0172488  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2675  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
157 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  21.43 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2777  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 
158 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.392987 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3957  MarR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
165 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432771  normal  0.0893513 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  24.66 
 
 
142 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0304  transcriptional regulator, MarR family  24.51 
 
 
146 aa  43.5  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.272256  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  43.4 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  27.73 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4190  transcriptional regulator, MarR family  25.35 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2084  transcriptional regulator, MarR family  27.4 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000746204  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  24.66 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6147  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.676081  normal  0.847722 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  23.21 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  23.21 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  23.21 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 
145 aa  41.6  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  22.11 
 
 
160 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 
150 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0013  MarR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
173 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2905  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.607898  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  24.39 
 
 
160 aa  40.8  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3350  transcriptional regulator, MarR family  28.72 
 
 
164 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0764351  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  28.75 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  23.77 
 
 
150 aa  40.8  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  24.43 
 
 
167 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0862  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
152 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.529832  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0820  MarR family transcriptional regulator  22.6 
 
 
146 aa  40.4  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1596  MarR family transcriptional regulator  20.49 
 
 
157 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
148 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
148 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
146 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5333  transcriptional regulator, MarR family  23.81 
 
 
154 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.828951 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  29.07 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4686  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
168 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000388035  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
202 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  25.77 
 
 
152 aa  40  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4274  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
146 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>