More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1964 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  293  5e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  38.54 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  37.11 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  38.32 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2500  MarR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.394742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  33.08 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0701  transcriptional regulator, MarR family  27.94 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255287  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2720  MarR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  30.15 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  36.28 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  38.36 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  36.23 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  41.03 
 
 		 175 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  34.72 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  35.85 
 
 		 157 aa  51.2  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2070  transcriptional regulator, MarR family  28.17 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.57 
 
 		 312 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3646  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 151 aa  50.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  31.91 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0304  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.272256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  32.43 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  27.45 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  38.57 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  32.98 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17310  regulatory protein, MarR family  30.21 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  42.31 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 189 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 173 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2732  hypothetical protein  29.08 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  25.89 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  36.9 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2243  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 148 aa  47.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  41.07 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  28.57 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.57 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.57 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.57 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.57 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  27.45 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03440  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.495444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  28.37 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.57 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>