163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0304 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0304  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 146 aa  288  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.272256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1929  MarR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 159 aa  94.7  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0438098  normal  0.235011 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2675  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0143  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000387335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  30.14 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2811  transcriptional regulator, MarR family  38.33 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.126784 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  26.83 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  36.71 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0238  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  34.67 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1398  transcriptional regulator, MarR family  30.68 
 
 		 312 aa  47.4  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0175  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 172 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8638  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.280895  normal  0.673509 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 158 aa  46.2  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  31.43 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8699  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 182 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2804  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000371866  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  34.78 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4190  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2326  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0540  transcriptional regulator  27.47 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20796  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 208 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  29.29 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1494  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.386446  hitchhiker  0.00719492 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2025  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 193 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  29.23 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  37.11 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  29.29 
 
 		 156 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 313 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0210  MarR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 224 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.133838 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1768  MarR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 151 aa  43.5  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  39.34 
 
 		 159 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 174 aa  43.5  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  43.5  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06185  transcriptional regulator, marR family protein  30.49 
 
 		 144 aa  43.5  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 		 172 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 		 166 aa  42.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  30.23 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2469  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1368  transcriptional regulator, MarR family  35.54 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  29.86 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  29.17 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  31.33 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3251  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  31.33 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  28.79 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0061  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  30.5 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0069  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  36.47 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 150 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2461  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 157 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.6439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  27.37 
 
 		 162 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2022  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 158 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  24.43 
 
 		 139 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1198  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 170 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  24.03 
 
 		 139 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  28.24 
 
 		 149 aa  41.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  24.43 
 
 		 139 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>