193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2720 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2720  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 168 aa  332  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2500  MarR family transcriptional regulator  71.21 
 
 		 133 aa  169  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.394742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37.5 
 
 		 320 aa  58.9  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  33.94 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  35.19 
 
 		 137 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 185 aa  52  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 172 aa  51.6  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 168 aa  51.2  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  31.58 
 
 		 166 aa  51.6  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0871  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 161 aa  51.2  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0438869  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  42.05 
 
 		 157 aa  51.2  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 161 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0789  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  31 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 		 166 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 186 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 158 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 178 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 		 187 aa  48.1  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 151 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 167 aa  47.8  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  28.33 
 
 		 187 aa  47.8  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  28.18 
 
 		 283 aa  47.8  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  30.65 
 
 		 318 aa  47.8  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  28.91 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1081  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.09 
 
 		 312 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2650  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038621  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 144 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 307 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4041  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  26.32 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1537  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  39.76 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  46.94 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_774  transcriptional regulator, MarR family  26.97 
 
 		 171 aa  45.8  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.489268  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  26.32 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  35.87 
 
 		 137 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  37.23 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4510  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 150 aa  45.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.88228  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  26.92 
 
 		 138 aa  45.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 		 186 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 148 aa  45.4  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  24.55 
 
 		 156 aa  45.1  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3592  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 174 aa  44.7  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 147 aa  44.7  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 149 aa  44.3  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0910  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 176 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236829  normal  0.0112951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7850  transcriptional regulator, MarR family  36.96 
 
 		 143 aa  44.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172522  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 152 aa  44.3  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3532  transcription regulator MarR-like protein  24.51 
 
 		 148 aa  44.3  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1178  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5564  regulatory protein, MarR  41.43 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2011  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  27.2 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1398  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 312 aa  43.9  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1852  accessory regulator A-like protein  24.11 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00201547  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4486  transcriptional regulator, MarR family  35.62 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.021686  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>