More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4041 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4041  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  42.99 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2326  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6436  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.408457 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1940  regulatory protein MarR  43.75 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.792334  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0379  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  30.07 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 170 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 187 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  30.4 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 174 aa  51.6  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  27.55 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 141 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 154 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 155 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  29 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  28.18 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 191 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  25.69 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  25.69 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  27.52 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  26.5 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 233 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  25.69 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  25.69 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 142 aa  48.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  30.09 
 
 		 177 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  27.47 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  26.06 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  25.49 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 170 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3701  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.156019 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  25.49 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1155  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 163 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 162 aa  47.4  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1172  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 163 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1182  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 163 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.937624  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1164  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.87 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0126682  normal  0.965749 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1175  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.87 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.051458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.87 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.763682  normal  0.971845 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1059  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.87 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  26.61 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1195  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.87 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.711605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 186 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 185 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  24.56 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  28.1 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 163 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 		 157 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4301  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.554811 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  40 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>