156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0379 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0379  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  386  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4666  MarR family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 180 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3697  MarR family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 180 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2413  MarR family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 180 aa  141  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3824  MarR family transcriptional regulator  46.11 
 
 		 180 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.765459  normal  0.539735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4699  hypothetical protein  33.07 
 
 		 160 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158619  normal  0.0406729 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3280  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.48286  normal  0.011902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3908  transcriptional regulator, MarR family  25.34 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0501  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.700871 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2144  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0843453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2140  regulatory protein, MarR  29.71 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2296  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4041  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0324  regulatory protein, MarR  28.12 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3135  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 184 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  38.03 
 
 		 144 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 150 aa  53.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 170 aa  52.4  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0540  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 		 170 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  43.28 
 
 		 159 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  27.35 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  40.51 
 
 		 157 aa  51.2  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1790  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2110  regulatory protein, MarR  29.55 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.450646  normal  0.261342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  29.85 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 177 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  29.09 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 143 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  29.13 
 
 		 146 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 157 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  40 
 
 		 169 aa  48.9  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 141 aa  48.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5020  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 139 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 166 aa  48.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 172 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  34.18 
 
 		 146 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0694  regulatory protein, MarR  32.08 
 
 		 171 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2174  regulatory protein, MarR  37.11 
 
 		 133 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 140 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 172 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 172 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 172 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 172 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 172 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 172 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 172 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2028  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.400753  hitchhiker  0.000427569 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2264  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 		 158 aa  46.2  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201704  normal  0.338142 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 147 aa  46.2  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  35.29 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0087  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 168 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.383416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 167 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 155 aa  46.2  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 146 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 147 aa  46.2  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 142 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 		 175 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 142 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 171 aa  45.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 162 aa  45.4  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 166 aa  45.1  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 146 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2923  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 158 aa  45.4  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  30.33 
 
 		 144 aa  45.4  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  38.53 
 
 		 148 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 166 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  36.9 
 
 		 150 aa  45.1  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 145 aa  45.1  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  31.94 
 
 		 283 aa  45.1  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 167 aa  44.7  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 168 aa  44.7  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 149 aa  44.7  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1269  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  48.44 
 
 		 338 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955314 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  29.81 
 
 		 162 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 169 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 177 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0540  transcriptional regulator  28.68 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20796  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0886  transcriptional regulator, MarR family  30.82 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  33.73 
 
 		 138 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  36.9 
 
 		 148 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 165 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3088  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 		 144 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00891754  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  27.88 
 
 		 162 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  25.6 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 157 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>