103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3135 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3135  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 184 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3280  MarR family transcriptional regulator  76.73 
 
 		 177 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.48286  normal  0.011902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3908  transcriptional regulator, MarR family  74.1 
 
 		 195 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2144  MarR family transcriptional regulator  74.67 
 
 		 177 aa  237  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0843453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4699  hypothetical protein  43.26 
 
 		 160 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158619  normal  0.0406729 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0087  MarR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 168 aa  115  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.383416 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0540  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0324  regulatory protein, MarR  41.78 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0501  MarR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.700871 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2134  regulatory protein, MarR  35.81 
 
 		 176 aa  84.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2290  transcriptional regulator, MarR family  35.81 
 
 		 176 aa  84.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.851644  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1790  transcriptional regulator, MarR family  31.29 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2140  regulatory protein, MarR  29.23 
 
 		 173 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2296  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 173 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0379  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  29.57 
 
 		 157 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 159 aa  52.8  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 162 aa  51.2  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1141  homoprotocatechuate degradative operon repressor  26.09 
 
 		 145 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  26.09 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0099  homoprotocatechuate degradative operon repressor  26.09 
 
 		 145 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1022  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  26.09 
 
 		 145 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1514  homoprotocatechuate degradative operon repressor  26.09 
 
 		 145 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687296  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  27.19 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  25.83 
 
 		 154 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2413  MarR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 180 aa  48.5  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 150 aa  48.5  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  25.83 
 
 		 154 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 150 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 150 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 150 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 146 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2262  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  25.22 
 
 		 145 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  29.63 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 143 aa  47.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 143 aa  47.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0937  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  25.22 
 
 		 145 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 148 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  29.73 
 
 		 141 aa  47.4  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01785  transcription regulator protein  28.57 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0810  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300222  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  26.55 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  26.67 
 
 		 153 aa  46.2  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 155 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 147 aa  45.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 151 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4551  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  28.85 
 
 		 146 aa  45.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3479  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.891709  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 155 aa  45.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 		 157 aa  45.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0803  transcriptional regulator, MarR family protein  22.14 
 
 		 148 aa  44.7  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 146 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 150 aa  44.7  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 159 aa  44.7  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4666  MarR family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  26.5 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3697  MarR family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 147 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3824  MarR family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.765459  normal  0.539735 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 153 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 154 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  28.42 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 145 aa  42.7  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 157 aa  42.4  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2248  transcriptional regulator, TrmB  23.73 
 
 		 154 aa  42.4  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3261  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 165 aa  42.4  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 147 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 147 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  22.78 
 
 		 157 aa  42  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3592  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 153 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.568766 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 155 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 		 153 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  34.21 
 
 		 161 aa  41.6  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 153 aa  41.6  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  22.54 
 
 		 152 aa  41.6  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 158 aa  41.2  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 165 aa  41.2  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>