35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2134 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2290  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 176 aa  343  7e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.851644  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2134  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 176 aa  343  7e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1790  transcriptional regulator, MarR family  42.51 
 
 		 174 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2140  regulatory protein, MarR  44.72 
 
 		 173 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2296  transcriptional regulator, MarR family  44.72 
 
 		 173 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4699  hypothetical protein  35.81 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158619  normal  0.0406729 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0501  MarR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 168 aa  85.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.700871 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2144  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 177 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0843453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0324  regulatory protein, MarR  34.48 
 
 		 169 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0087  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 168 aa  85.1  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.383416 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3280  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 177 aa  84.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.48286  normal  0.011902 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3135  MarR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 184 aa  84.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3908  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 195 aa  80.9  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0540  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 143 aa  45.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1297  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 132 aa  44.3  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 150 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  29.27 
 
 		 158 aa  42  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 154 aa  41.6  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 174 aa  42  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 147 aa  42  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 156 aa  41.6  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1265  transcriptional regulator, MarR family  40.85 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000976075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 157 aa  41.6  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  41.2  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 176 aa  40.8  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  34.41 
 
 		 155 aa  40.8  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 154 aa  40.8  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  30.33 
 
 		 155 aa  40.8  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>