144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1265 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1265  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
163 aa  330  5e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000976075  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3108  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159127 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
208 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1865  transcriptional regulator, MarR family  40.24 
 
 
177 aa  52.4  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281666  normal  0.52003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6171  Transcriptional regulators-like protein  31.86 
 
 
166 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0629  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0229428  normal  0.101426 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2243  transcriptional regulator, MarR family  38.67 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355574  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
155 aa  48.5  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  33.33 
 
 
163 aa  47.8  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
159 aa  47.8  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0098  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
166 aa  47.8  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2918  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 
213 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0213  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 
270 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3344  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 
270 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3392  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
270 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1624  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
270 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2977  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
270 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5333  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.828951 
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2985  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
212 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0529502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0070  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
212 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  26.6 
 
 
151 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0070  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
212 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0088  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
212 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  28.72 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3251  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
212 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4112  regulatory protein MarR  40 
 
 
179 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0061  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
212 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4012  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 
200 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 
151 aa  45.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4084  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 
200 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574763  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
147 aa  45.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
141 aa  45.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0069  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
212 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373152  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
171 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  21.01 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 
172 aa  45.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 
171 aa  45.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
152 aa  45.1  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
152 aa  44.7  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
152 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  23.53 
 
 
152 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
152 aa  44.7  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  28.57 
 
 
153 aa  44.7  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  23.53 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
150 aa  44.3  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 
153 aa  44.3  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2624  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
166 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000470188  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4529  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
166 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000513075  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
198 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
191 aa  43.9  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 
191 aa  43.9  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  41.27 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  35.48 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 
160 aa  43.9  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  22.32 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  26.37 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  23.53 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  23.53 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  29.76 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1592  transcription regulator protein  25 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  24.78 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  30.33 
 
 
171 aa  43.1  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0003  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
212 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838682  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06990  transcriptional regulator  33.04 
 
 
188 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.606707  normal  0.0260883 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
212 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1494  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.386446  hitchhiker  0.00719492 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  28.09 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  28.09 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5309  Transcriptional regulator  39.66 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00683555  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 
162 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 
162 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  35.56 
 
 
168 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  28.09 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  30.68 
 
 
296 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
144 aa  42.4  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 
160 aa  42.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  21.49 
 
 
152 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
148 aa  42.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3063  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
214 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565179  normal  0.590776 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>